十一月二十六日，在得知大员港的联合舰队被重创之后。荷兰人的主力舰队，欲返回荷兰占的东印度殖民地，打算重新集结力量，再反扑。

    但荷兰人，不想轻易在就此离去；因为他实力还很强，要是十七战舰不发一炮，就那么回去，也说不过去。于是乎打算；从盟军舰队那里占点便宜再走，那么，巴丹海战就不可能避免了。

    二十七日上午初时；此时，平静的大海好像是一个蓝色的世界，无风无浪，心平气和，而又有谁知道这平静之中隐藏着危机呢？平静是大海虚假的一面。荷兰人据了解到，盟军与之对峙的舰队当中，苏方率领船队最弱，并且在舰队的右侧，被葡萄牙人的舰队所保护着。

    下午午时正，荷兰舰队率先攻击盟军舰队；并且目标直指盟军舰队中，最弱的苏方船队。盟军舰队不甘示弱，全部迎击来犯的荷兰舰队。对于荷兰人的阴谋，盟军并不知情，但由于前锋西班牙船队，以及左翼的牧宜年船队北上袭击大员而去。

    使得盟军舰队队形，发生了变化；原先的中军舰队主力被安排到右翼，而右翼的牧宜年船队，则临时充当当前锋。正是盟军内部阴错阳差的调动，使得荷兰舰队绕过牧宜年最弱的船队，反而，逆风而上攻击盟军中最强的战队——葡萄牙舰队。

    开战之初，荷兰人那会想到敌右翼并没轻易被打垮，反而遭其猛烈的攻击。最后荷兰人才发现问题，右翼根本就是葡萄牙人的主力，但发现为时已晚；葡萄牙舰队在顺风的情况下，迅速地冲击荷兰舰队。牧宜年的船队在前面向右迂回至荷兰人的舰队后，与葡萄牙舰队一起前后下了荷兰舰队的饺子。

    苏方的四条火船，趁此机会从敌舰队侧后，驶至敌船前上搭钩点火。四条小火船每一艘盯上了一艘敌船，被点着的荷兰战船遭烧毁；荷兰舰队被火船攻得一下子击乱了阵脚，盟军趁势发起强度更大的打击，在盟军猛烈的打击之下。

    荷兰舰队六艘遭击沉，一艘遭掳获，其余船只在面对盟军前后夹击的强大实力攻击下，全部在受重伤后，冲破了苏方船队的围困逃走了。至此荷兰舰队十七艘战船，被焚毁四艘，被击沉六艘，盟军俘获一艘敌船。此战中，盟军杀死荷兰人二百余人，但沉船溺者死亡不计，也无法推算，获得被俘敌船的一些刀剑火器，及物品等。

    是故，参战的十七艘荷兰舰队，只逃脱了六艘。盟军方面；葡萄牙舰队被击沉二艘，但实力依然雄厚。不过是苏方船队有不少损失；在盟军合围荷兰舰队之后，荷兰人察觉到苏方这边较弱以后，一真猛攻这侧。致使苏方十一艘被击沉了四艘，重伤五艘，伤亡船员人数超过三百人。